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近年来，通过不断加强和完善阿里工程预算工作，使管理更加深入，阿里工程预算程序进一步规范，取得了显著的经济效益。但仍存在不少的问题，归纳起来，主要有以下几点。由于受区域和专业限制，评标专家库专家人数较少，对评标工作的开展造成一定影响。现有专家49人，分属14个专业，平均每一专业仅有2－3名专家，人数相对偏少，另外还有18名专家担任副科级以上的领导职务，公务繁忙，难于专心从事评标工作。由于信息不够畅通，不能够了解设备发展的新动向，不能够掌握厂家生产的产品，邀请的投标厂家一般只有3－4家，多数厂家为曾经采用过的产品，一是为配套，二是为稳妥，无形当中就会可能导致违悖尽可能采用新设备、新材料、新工艺原则，不仅难以实现提高投资效益，降低工程成本的目的，而且会直接影响阿里工程预算的公正性与合法性。个别阿里工程预算准备工作不充分，不细致。在开标前未认真进行工程图纸会审和市场调研，导致技术要求不准确，从而引起厂家的投标方案和报价与实际有一定出入，影响了阿里工程预算工作的进度由于技术原因，目前评标专家信息库尚未建成，评标小组的组建尚不能实现微机自动检索，难免受到人为因素的干扰。鉴于上述情况和问题，2003年要继续加强对阿里工程预算管理工作的领导，进一步完善阿里工程预算制度，提高人员业务水平，努力降低工程成本，提高经济效益，为企业生产经营工作服务。阿里工程预算管理工作的具体改进措施是：
在计算工程量中要使用大量的数据计算公式，如何正确地使用它们是阿里工程阿里工程预算人员在工程量计算上的一个课题，用得准确合理能提高工程量计算的速度和质量。工程量计算主要涉及的是长度、面积和体积、重量及个数等，建筑物设计常用的几何图形等平面图形，正方及长方体、圆柱及圆台体、棱柱及棱台形、球形体等立体图形，均可采用数学几何计算公式完成工程量计算。勾股弦定理、三角函数可以用来求得未知线段的长度。上述这些常用的计算公式我们必须熟练地记住，灵活地加以应用。一些常使用的数据可以通过一次算出多次使用的原则将这些数据编制成数据表作为日常备用数据，这样可以节省计算时间，且能避免重复计算和漏算。正确套用定额直接费的正确与否直接影响到后面的取费以及造价终的工程造价。所以必须正确套用定额，保证准确合理。
工程预算随着我国经济的迅速发展 加强了基本建设力度在取得巨大成就的同时也出现了一些值得重视的问题。如某些施工单位为了追求自身的利益，在基建工程上营私舞弊，频频出现高估冒算的现象。根据以往工作经验，进行工程决算审计常发现的问题有：多列工程项目、工程量不实、高套定额、乱取费用等问题。为了管理好并合理使用基建资金提高投资效益和维护建设方利益加强基建工程决算的审计工作非常重要。开展工程决算审计主要从以下几个方面入手。
承包工程合同签定不规范，工程结算计价难以确定。工程预算在审计过程中发现，建设、施工双方承包工程合同签订不规范。在签订合同时不按投标文件的内容逐一填写，尤其是建筑规模和中标价，存在少填或者不填的现象，给工程计价取费留下活口，目的是为了竣工后高报工程结算价格打下伏笔，使得原本十分严肃的合同失去约束作用，建设单位失去了对施工单位工程报价的有效监督，容易造成决算价格偏高。同时，给工程结算造价审核带来难度和风险。
