由于水下作业比陆上工作条件复杂，操作技术要求高，因而只有在特殊情况下才采用。
水下堵漏清基 ①建筑物基面的清理：当水生物或水垢、水锈较轻时，用竹刷、钢丝刷、刮刀、砍斧、凿子或风动砂轮等清理;较重时则用高速射流水清洗。②基坑清理：一般由潜水员辅以提升工具进行;当工作面或工作量大时，则先用挖掘机、挖泥船或气泵进行初步清理。
水下钻孔 当孔深及孔径较小或在竖直面上钻孔时，可用风动凿岩机钻孔，由潜水员在水下直接操作。当在闸坝上游进行帷幕补强灌浆或钻大孔径 孔时，一般采用设在船台或浮排组成的工作台上的回转钻机钻孔。20世纪60年代以来，欧洲、美洲一些 和日本广泛采用了双套管(其外套管用以固定钻孔位置，保护钻具免受流水冲击;内套管头部镶有环形钻头，可以钻透覆盖层达到基岩中)在深水域钻孔。
冬季过冷的低温会对正常的水下工作造成影响。而这种影响则主要表现在两个方面。一方面，低温会让水下的温度极速下降，这对正常的下水工作造成了困难。 另一方面，工作人员再入水时需要做好长时间的准备工作，包括拉伸身体和热身运动！否则，水下的寒气会在短时间内侵入到潜水员体内，造成潜水常见的肌肉酸痛和痉挛等。
低温易导致肌肉发生短暂性抽筋或痉挛的现象，水下打捞作业时如果不提前做好防患措施，就有可能造成重大安全事故的发生。
１、探明水况。在进行水下作业之前，提前派遣队员对水下工程状况、水流速度、水温、能见度等要素进行搜集和整理是预防水下事故发生的 要素。潜水队员必须在详尽了解相关息后制定出工程方案和需要配备的装备等。
2、适应水温。在做好万全准备后，下水前，潜水队员可通过淋浇冷水或提前热身的方式让自己迅速适应水温。下水后，切记不要迅速加快自己的速度，而应该循序渐进的增大自己的活动量。
3、紧急应对。在水下发生肌肉痉挛或抽筋后，首先要做到不慌不乱，用手对痉挛的肌肉处进行按压和修复，同时通过通讯设备告知周围的潜水和工作人员自己的状况。
4、上岸恢复。如果通过按压能够恢复行动能力，则应立刻自我终止工作，上浮回到岸边。否则也应在其他人员的救援下迅速回到水面恢复。
总之在下水前首先做好水下探摸工作，试探水况，做好充分的准备，根据情况来出可行性方案，保证安全。
为确保员工包括潜水员、电话员、信绳员等都需要有可靠的潜水员进行但热操作，禁止非正式潜水员代替。工程潜水作业开始后，潜水作业船只应悬挂信号旗，夜间作业时应悬挂信号灯，保证照明作业良好。
1、在潜水作业的水底行动中，如果发现与作业无关的障碍物、深坑和深洞，应绕行。如果不能绕行，需要从障碍物上方经过。超过障碍物后，需要仔细检查清理信号绳和软管。进坑进洞时，需要先脚后身，随时向水面说明情况。
水下作业
2、清理信号绳、软管和移动绳，区分好方向和水流，并指示水面到达工作地址或沿移动绳移动。在有流状态下，一般应顶流或或侧流动作，如流急也可采用侧退动作，通常禁止顺流而下。潜水员着底后适当增加通风量。水下作业时，注意头盔不要低于胸部。
3、潜水员在水下工作时，应经常与水面电话员联系。电话产生毛病时，可用信号绳联络。当电话和信号绳均产生毛病时，可用供气管联络，并应当即出水。潜水员需要严格执行水面电话员的指令。遇到危险或故障时，应立即通知水面电话员，一起坚持镇静，设法自救或等待水面潜水员协作解救。
4、潜水作业船应避开起重船的船缆活动规模。禁止悬挂物在空中超过潜水作业船。潜水员在水下设备作业中，需要在部件稳定后才能进入作业点，坡面设备必须从上坡靠近部件。