工程预算如果是预算结算承包，审计的重点是核查乙方提出的设计变更资料是不是通过了原来设计部门的同意或是经过了甲方的签证，这里的重大设计变更有没有计划或者是主管部门的审批手续，变更工程量的计算是不是真实，套用定额与单价是不是合适且准确，设计变更的增减是不是同步，有没有巧立名目、自行定价、搭车收费的现象。预算加系数或是平方米等价已经承包，审计的重点原则上已经把预算的变动，加价系数等算在内，因此不应该再零星项目变动经济洽谈。如果是招标承包，审计的重点是结算应该按中标合同的标价执行，当然遇到特殊复杂工程可以调价，也要有补充的合同，否则就不应该在 的结算关头再另行加价。
工程预算在目前审计审计任务日益繁重 ，而审计力量相对有限的情况下 ，审计人员如何根据工程项目的实际情况选择工程预算审计方法，以便提高审计效率，又快又好地完成审计任务随着 经济快速发展及投资的增长，建设项目投资审计受到社会各界的空前重视。工程预算审计是政府投资项目审计的重要组成部分，特别在节约建设资金、提高项目管理水平方面具有显著作用。近年来，随着政府基本建设力度的加大，投资审计倍受社会各界关注，各级政府部门对投资高重视，这对审计和审计人员来说，既是一种鼓励，
工程预算通过分析各项费用指标来找出工程预算审计的突破口，准确完整的反映工程的实际造价。如对某单位一建筑项目进行审计，审计人员通过审查发现该项目与以往审计过的某幢建筑物A的设计完全想同，经过测算该项目的经济造价指标和部分材料指标均高出A建设工程，审计人员进一步审计发现该项工程多计钢材16.3t；商品砼多计128.8m3。由于上年价格指数变动不大，且使用的是同一估价本，所以审计人员在审计过程中只考虑价差问题未考虑价格上涨指数，审计人员核减工程预算合计15.78万元。
工程预算编制要求：（GBJ83-85）《建筑结构工程预算编制通用符号、计量单位和基本术语》（GBJ9-87）《建筑结构荷载规范》（GBJ10-89）《混凝土结构工程预算编制规范》（GBJ3-88）《砌体结构工程预算编制规范》（JGJ73-91）《建筑装饰工程施工及验收规范》代替（GBJ210-83）《装饰工程施工及验收规范》91.12.1施行GBJ300-88）《建筑安装工程质量检验评定标准》（GBJ301-88）《建筑工程工程质量检验评定标准》（GBJ302-88）《建筑采暖卫生与煤气工程质量检验评定》（GBJ303-88）《建筑电气安装工程质量检验评定标准》（GBJ304-88）《通风与空调工程质量检验评定标准》（GBJ310-88）