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碳源之葡萄糖 玉米淀粉及其水解液是抗生素、氨基酸、核昔酸、酶制剂等发酵中常用的碳源。马铃薯、小麦、燕麦淀粉等用于有机酸、醇等生产中。液化淀粉可被微生物产生的胞外淀粉酶和糖化酶逐步分解成葡萄糖，被菌体吸收利用。根据微生物利用碳源速度的快慢，可将碳源分为速效碳源），如葡萄糖、燕糖；迟效碳源，如乳糖、淀粉。葡萄糖等易被菌体迅速利用的糖类对许多产物合成有反馈调节作用，应注意控制其浓度，或与被菌体缓慢利用的多糖组成混合碳源，有利于目标产物的合成。如青霉素发酵中，葡萄糖能阻過青霉素的合成，而乳糖对青霉素的合成几乎无阻過作用。如果采用成本较低的葡萄糖作为青霉素合成的碳源，需采用流加等控制方式。
碳源 此时细菌利用氮元素变成矿化作用为主，将无机氮变成有机氮，并部份排向环境中。导致水体中，尤其是底部氨氮等有毒物质大量产生，一旦发生降温天气，表层水温低于底层水温，这个时候，表层水的密度大往下沉，底层水温高于表层水，密度轻，底层水往上冒，此时底层水中那些有毒物质就是会窜到上层水，一方面消耗上层水体中的氧气养殖生物缸氧，另一方面让对虾中毒甚至死亡。 这样的水体一方面可以通过改底，部份消除底部这些有毒成份；另外就是通过向水体里补充碳源，在高碳氮比的情况下，细菌利用氮元素的方式以吸收为主，即吸收有机氮 ，也吸收无机氮 ，从而改善了有毒氮化物的积累，改善了养殖环境
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碳源--醋酸钠 乙酸钠 除磷工艺：Z=进水量*（15*TP差值-C差值）/ 碳源COD当量其中:Z——除磷工艺碳源投加量TP差值——进水TP-排放要求的TPC差值——进水COD-出水COD脱氮除磷工艺：W=进水量*（5*N差值2+15*TP差值-C差值）/碳源COD当量其中:W——脱氮除磷工艺碳源投加量N差值2——进水TN-排放要求的TNTP差值——进水TP-排放要求的TPC差值——进水COD-出水COD
