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碳源是微生物生长一类营养物，是含碳化合物。常用的碳源有糖类、油脂、有机酸及有机酸酯和小分子醇。 根据微生物所能产生的酶系不同，不同的微生物可利用不同的碳源。碳源对微生物生长代谢的作用主要为提供细胞的碳架，提供细胞生命活动所需的能量，提供合成产物的碳架。 在对虾养殖中，高密度精养池后期常采用添加葡萄糖或是甘蔗糖来补充水体的碳源。为什么要向水体里补充碳源，主要是看碳氮比。 微生物生长繁殖中，要向环境中吸收各种营养物质，主要有碳源、氮源、能源、生长因子、无机盐和水。当碳源和氮源比值过低，碳元素的含量成为细菌生长的瓶颈，影响氮元素的利用。
碳源之葡萄糖 玉米淀粉及其水解液是抗生素、氨基酸、核昔酸、酶制剂等发酵中常用的碳源。马铃薯、小麦、燕麦淀粉等用于有机酸、醇等生产中。液化淀粉可被微生物产生的胞外淀粉酶和糖化酶逐步分解成葡萄糖，被菌体吸收利用。根据微生物利用碳源速度的快慢，可将碳源分为速效碳源），如葡萄糖、燕糖；迟效碳源，如乳糖、淀粉。葡萄糖等易被菌体迅速利用的糖类对许多产物合成有反馈调节作用，应注意控制其浓度，或与被菌体缓慢利用的多糖组成混合碳源，有利于目标产物的合成。如青霉素发酵中，葡萄糖能阻過青霉素的合成，而乳糖对青霉素的合成几乎无阻過作用。如果采用成本较低的葡萄糖作为青霉素合成的碳源，需采用流加等控制方式。
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