分包工程竣工结算审计是分包工程全过程跟踪审计的第三步，是对分包工程预算的终确定。分包工程预算的合理性和准确性，直接体现着分包工程的审计质量和审计成果严格复核结算工程量。对结算工程量要严格审查和准确计算，将工程量的计算及变更签证的确认作为审计重点，注意工程量的重复和多计，增强对虚假变更签证的辨别力。工程量的确定要依据施工图和业主或建设单位签发的公务通知单、设计部门的设计变更单。尤其对现场变更工程量的确认，严防只计增不计减，要把握住“在一般情况下，有增必有减”的原则，如果有增无减，就要查明原因。对野外偏僻的施工签证，要有现场各级人员的签认，否决“一言堂”签证。
工程预算审核是运用科学、技术原理和经济法律手段，解决工程建设活动中工程预算的确定与控制．从而达到提高投资效益的经济效益目的的行为，是确定造价的实施过程和行为根据项目审计与工程预算审核在依据、标的、目的、法律效力、从业人员等方面是有本质区别。
工程预算编制规范和标准：
《工程测量规范》GB50026-93
《土方与 工程施工及验收规范》GBJ201-83
《工程测量基本术语标准》GB/T50123-9
《建筑地基基础工程施工质量验收规范》GB50202-2020
《地下防水工程施工及验收规范》按承包合同确定的结算方式确定结算总价，在初审结算书、与承包方核对时依据合同，进行甲供材料、配合管理费及责任扣款等费用的确认、扣除；
工程预算的竣工具体要求：
1、工程已达到甲方竣工要求。
2、各个系统的功能说明，设备配备情况，以及图例配备齐全，达到完整的竣工资料。
如何搞好竣工结算：
1、企业领导的重视。
2、编制人员具备各种工程的规范。
3、商签公平合同条款，为结算编制提供必要条件。施工技术资料填写质量要求：1、归档的工程预算应为原件。2、工程预算的内容及其深度必须符合 有关工程勘察、工程预算编制、施工、监理、等方面的技术规范、标准规程。3、工程预算的内容必须真实、准确、与工程实际相符合。4、工程预算应采用耐久性强的书写材料，如碳素墨水，不得使用易褪色的书写材料，如红色墨水、纯蓝墨水、圆珠笔、复写纸、铅笔等。5、工程预算应字迹清楚，图样清晰，图表整洁，签字盖章手续完备。