各单位工程预算编制要根据不同的预算定额及相应的费用定额等文件来进行。一般情况下，在充分熟悉掌握定额的内涵、工作程序、子目包括的内容、建设工程量计算规则及尺度的同时，深入建设工程线，收集资料、积累知识、着手编制。施工图预算编制有两种方法，种单价法，第二种实物量法，不管用哪种方法都需要依循预算编制程序及步骤。搜集资料，做好准备工作。项目的投资预测要做好需要的资料很多，比如工程所在地的水电路情况、地质状况、主要材料设备的价格、大宗材料的采购地及其现有已建的类似工程的资料。还要收集对于做经济评价的项目设立地的经济发展前景、周围环境、同行业的经营等相关资料。在编制前，预算人员应该先到工地现场对工程现场进行考察，熟悉施工工序、施工要求、技术要求及其新材料、新技术、新设备、新工艺在工程中的应用。详细研究施工图纸。预算在进行前，要对图纸仔细研读，必要的时候要与设计人员进行交流，对于图纸的设计情况要全面了解。各项工程量的计算。
工程预算签证是施工合同和施工图中未包括，且预算定额取费也未考虑的，而实际施工中又确实发生费用的内容，需要做现场工程签证。一般由承包商提出，监理工程师或发包商核实签字批准。工程签证产生的原因主要有由于不可预见的因素产生的工程签证。如基础开挖时，发现有软弱下卧层等不良地基，需进行换填，这时需发包商现场管理人员核实后工程签证。一般来说在合同当中会就此做出相应的规定，例如因恶劣天气、一周内累计超过8小时的停水停电等造成的工期工程签证、经济工程签证等。由于发包商原因等非承包商原因，工程中途停建、缓建或未按合同规定的时间和要求提供材料、场地、设备资料等造成承包商的停工、窝工、返工而发生的倒运、人员和机械的调迁、二次搬运等损失。与设备安装工程等其他工程交叉作业产生的工程签证。
工程预算工程变更是指在因设计文件或技术规范修改而引起的合同变更，具体来说是指设计变更、施工条件变更、进度计划变更以及原招标文件和工程量清单中未包括的“新增工程”等。设计变更是工程变更中典型的一种，是工程施工过程中为保证设计和施工质量、纠正设计错误以及为了满足现场施工环境条件变化而进行的设计修改完善工作，一般由设计单位提出并出具设计变更通知单。设计变更产生的原因主要有由于设计单位本身的疏忽或对设计规范、工程的使用功能等没有完全理解而造成的设计不合理或遗漏。例如，在建筑室外工程中没有考虑地基沉降的严重性，只是要求对回填土夯实，有经验的承包商预计在雨水冲刷的情况下，地基沉降会造成建筑入口、室外平台等处混凝土开裂，建议增加配筋，经设计单位核实后出具设计变更通知单。由于市场行情变化或不可预见的地质、天气、环境变化导致原施工图中的材料、结构尺寸或工程做法不能实施，经设计单位核实后出具设计变更通知单。
例如，在某工程造价进行审计时，发现程项目很多，投资较大 ，如要对每个项目都进行审计，将要耗费大量的时间和精力。针对这一情况 ，审计人员在制定审计实施方案时 ，决定采用重点抽查法进行本次工程预算。经排查 ，发现天花进口矿棉板报价80 元/ m2，这个价格比市场上同类产品高出许多，为了保证审计质量，降低审计风险，审计人员一方面要求有关单位提供该进口材料的海关报关单、购销合同和发票 ，另一方面又持单位介绍信到该进口矿棉板代理处直接查询，经过三番两次的调查取证 ，终于在较短的时间内了解到有关该材料的实际价格情况。在确凿证据的面前，有关单位终同意按 56 元/m2进行结算，仅此一项就核减工程造价 1556167.60 元 ，为政府节约了大量的财政资金。又可称为经验法。在工程预算过程中，通常会发现不同的项目中存在相同或类似的问题 ，这些问题工程造价结算的“通病”，通过审计这些典型问题 ，可以达到较好的审计效果。在审计工作中常遇到的典问题的主要特征有以下几种。涂改原始签证资料或虚列工程项目。有关单位工作人员在送审计资料时，私自涂改原始签证资料或虚列工程项目，企图蒙混过关 ，达到个人的。因此 ，审计人员必须仔细对照原始签证资料，认真核实每一份复印文件的真伪。增加工程是“猫腻”较多的地方 ，究其原因 ，主要是设计单位设计深度不够，建设单位责任心不强。